MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Listeria monocytogenes M7 chromosome

Total Repeats: 67715

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017537	AC	3	6	36	41	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
2	NC_017537	T	6	6	221	226	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_017537	TACAT	2	10	291	300	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
4	NC_017537	A	6	6	301	306	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_017537	G	6	6	307	312	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
6	NC_017537	CAAT	2	8	322	329	50 %	25 %	0 %	25 %	386025289
7	NC_017537	A	8	8	364	371	100 %	0 %	0 %	0 %	386025289
8	NC_017537	CAA	2	6	407	412	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386025289
9	NC_017537	TAT	2	6	441	446	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386025289
10	NC_017537	AAT	2	6	457	462	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386025289
11	NC_017537	GAA	2	6	568	573	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386025289
12	NC_017537	GCA	2	6	706	711	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386025289
13	NC_017537	GGA	2	6	766	771	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386025289
14	NC_017537	CAA	2	6	820	825	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386025289
15	NC_017537	TTA	2	6	881	886	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386025289
16	NC_017537	ATA	2	6	899	904	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386025289
17	NC_017537	GAA	2	6	910	915	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386025289
18	NC_017537	CTTA	2	8	945	952	25 %	50 %	0 %	25 %	386025289
19	NC_017537	TGA	2	6	954	959	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386025289
20	NC_017537	AAG	2	6	980	985	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386025289
21	NC_017537	AC	3	6	1016	1021	50 %	0 %	0 %	50 %	386025289
22	NC_017537	ATG	2	6	1025	1030	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386025289
23	NC_017537	ATT	3	9	1042	1050	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386025289
24	NC_017537	GACC	2	8	1057	1064	25 %	0 %	25 %	50 %	386025289
25	NC_017537	CCA	2	6	1138	1143	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386025289
26	NC_017537	A	6	6	1174	1179	100 %	0 %	0 %	0 %	386025289
27	NC_017537	AGT	2	6	1278	1283	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386025289
28	NC_017537	TTC	2	6	1290	1295	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386025289
29	NC_017537	TAA	2	6	1302	1307	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386025289
30	NC_017537	GCA	2	6	1327	1332	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386025289
31	NC_017537	TTA	2	6	1373	1378	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386025289
32	NC_017537	AAG	2	6	1394	1399	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386025289
33	NC_017537	AGA	2	6	1428	1433	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386025289
34	NC_017537	A	7	7	1443	1449	100 %	0 %	0 %	0 %	386025289
35	NC_017537	AG	3	6	1498	1503	50 %	0 %	50 %	0 %	386025289
36	NC_017537	TGA	2	6	1533	1538	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386025289
37	NC_017537	TGG	2	6	1542	1547	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386025289
38	NC_017537	A	6	6	1580	1585	100 %	0 %	0 %	0 %	386025289
39	NC_017537	ACT	2	6	1593	1598	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386025289
40	NC_017537	A	7	7	1640	1646	100 %	0 %	0 %	0 %	386025289
41	NC_017537	CTATTA	2	12	1787	1798	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
42	NC_017537	T	6	6	1805	1810	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_017537	ATTA	3	12	1811	1822	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_017537	A	7	7	1849	1855	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_017537	AAC	2	6	1939	1944	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386025290
46	NC_017537	ATG	2	6	1980	1985	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386025290
47	NC_017537	ATG	2	6	2052	2057	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386025290
48	NC_017537	TGG	2	6	2083	2088	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386025290
49	NC_017537	TTC	2	6	2094	2099	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386025290
50	NC_017537	TCG	2	6	2125	2130	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386025290
51	NC_017537	AGA	2	6	2137	2142	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386025290
52	NC_017537	ACCAA	2	10	2172	2181	60 %	0 %	0 %	40 %	386025290
53	NC_017537	TACT	2	8	2349	2356	25 %	50 %	0 %	25 %	386025290
54	NC_017537	ATT	2	6	2369	2374	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386025290
55	NC_017537	AAAT	2	8	2380	2387	75 %	25 %	0 %	0 %	386025290
56	NC_017537	GAA	2	6	2456	2461	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386025290
57	NC_017537	TAAA	2	8	2499	2506	75 %	25 %	0 %	0 %	386025290
58	NC_017537	GAT	2	6	2513	2518	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386025290
59	NC_017537	AATC	2	8	2526	2533	50 %	25 %	0 %	25 %	386025290
60	NC_017537	AAT	2	6	2549	2554	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386025290
61	NC_017537	TTAAA	2	10	2565	2574	60 %	40 %	0 %	0 %	386025290
62	NC_017537	TTA	2	6	2661	2666	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386025290
63	NC_017537	TAA	2	6	2725	2730	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386025290
64	NC_017537	TTA	2	6	2733	2738	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386025290
65	NC_017537	GAA	2	6	2837	2842	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386025290
66	NC_017537	ATG	2	6	2870	2875	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386025290
67	NC_017537	TGA	2	6	2899	2904	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386025290
68	NC_017537	T	7	7	3055	3061	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_017537	ATG	2	6	3121	3126	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386025291
70	NC_017537	ACA	2	6	3136	3141	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386025291
71	NC_017537	GAT	2	6	3216	3221	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386025291
72	NC_017537	TTG	2	6	3233	3238	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386025291
73	NC_017537	GCTG	2	8	3261	3268	0 %	25 %	50 %	25 %	386025291
74	NC_017537	T	7	7	3294	3300	0 %	100 %	0 %	0 %	386025291
75	NC_017537	ATT	2	6	3313	3318	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386025291
76	NC_017537	CGT	2	6	3339	3344	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386025291
77	NC_017537	T	6	6	3419	3424	0 %	100 %	0 %	0 %	386025291
78	NC_017537	ATT	2	6	3430	3435	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386025291
79	NC_017537	CTT	2	6	3469	3474	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386025291
80	NC_017537	GAT	2	6	3505	3510	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386025291
81	NC_017537	T	7	7	3518	3524	0 %	100 %	0 %	0 %	386025291
82	NC_017537	ACC	2	6	3526	3531	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386025291
83	NC_017537	TA	3	6	3560	3565	50 %	50 %	0 %	0 %	386025291
84	NC_017537	GGC	2	6	3573	3578	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386025291
85	NC_017537	T	7	7	3617	3623	0 %	100 %	0 %	0 %	386025291
86	NC_017537	T	6	6	3657	3662	0 %	100 %	0 %	0 %	386025291
87	NC_017537	TGT	2	6	3666	3671	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386025291
88	NC_017537	GCT	2	6	3697	3702	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386025291
89	NC_017537	TTCT	2	8	3713	3720	0 %	75 %	0 %	25 %	386025291
90	NC_017537	CTG	2	6	3725	3730	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386025291
91	NC_017537	GC	3	6	3786	3791	0 %	0 %	50 %	50 %	386025291
92	NC_017537	ACT	2	6	3813	3818	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386025291
93	NC_017537	GTTC	2	8	3860	3867	0 %	50 %	25 %	25 %	386025291
94	NC_017537	TAA	2	6	3899	3904	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386025291
95	NC_017537	TCA	2	6	3916	3921	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386025291
96	NC_017537	CAG	2	6	3938	3943	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386025291
97	NC_017537	AGC	2	6	3990	3995	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386025291
98	NC_017537	TCC	2	6	3997	4002	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386025291
99	NC_017537	AGT	2	6	4074	4079	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386025291
100	NC_017537	TTA	2	6	4135	4140	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386025291
101	NC_017537	TTA	2	6	4169	4174	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386025291
102	NC_017537	TTAC	2	8	4188	4195	25 %	50 %	0 %	25 %	386025291
103	NC_017537	TTTAT	2	10	4206	4215	20 %	80 %	0 %	0 %	386025291
104	NC_017537	AGTT	2	8	4301	4308	25 %	50 %	25 %	0 %	386025291
105	NC_017537	TGG	2	6	4363	4368	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386025291
106	NC_017537	A	7	7	4436	4442	100 %	0 %	0 %	0 %	386025291
107	NC_017537	TAA	2	6	4471	4476	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
108	NC_017537	A	8	8	4475	4482	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
109	NC_017537	T	8	8	4505	4512	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
110	NC_017537	AATA	2	8	4513	4520	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
111	NC_017537	C	6	6	4525	4530	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
112	NC_017537	A	7	7	4543	4549	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
113	NC_017537	AT	3	6	4562	4567	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
114	NC_017537	TAT	2	6	4582	4587	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
115	NC_017537	A	7	7	4621	4627	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
116	NC_017537	TGAT	2	8	4703	4710	25 %	50 %	25 %	0 %	386025292
117	NC_017537	TGG	2	6	4722	4727	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386025292
118	NC_017537	AACC	2	8	4977	4984	50 %	0 %	0 %	50 %	386025293
119	NC_017537	CTTGCA	2	12	5005	5016	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	386025293
120	NC_017537	TAT	2	6	5049	5054	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386025293
121	NC_017537	AGA	2	6	5064	5069	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386025293
122	NC_017537	GGA	2	6	5223	5228	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386025293
123	NC_017537	ATTT	2	8	5302	5309	25 %	75 %	0 %	0 %	386025293
124	NC_017537	GCG	2	6	5488	5493	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386025293
125	NC_017537	TCA	2	6	5499	5504	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386025293
126	NC_017537	A	6	6	5603	5608	100 %	0 %	0 %	0 %	386025293
127	NC_017537	AATC	2	8	5612	5619	50 %	25 %	0 %	25 %	386025293
128	NC_017537	GTG	2	6	5639	5644	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386025293
129	NC_017537	GAT	2	6	5668	5673	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386025293
130	NC_017537	GAA	2	6	5779	5784	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386025293
131	NC_017537	TTC	3	9	5801	5809	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386025293
132	NC_017537	GAT	2	6	5812	5817	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386025293
133	NC_017537	CGA	2	6	5832	5837	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386025293
134	NC_017537	ACA	2	6	5896	5901	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386025293
135	NC_017537	CAA	2	6	5939	5944	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386025293
136	NC_017537	A	7	7	5970	5976	100 %	0 %	0 %	0 %	386025293
137	NC_017537	TGA	2	6	6000	6005	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
138	NC_017537	AAAG	2	8	6007	6014	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
139	NC_017537	AAT	2	6	6023	6028	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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253	NC_017537	A	6	6	10724	10729	100 %	0 %	0 %	0 %	386025296
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